Auch in der Mundhöhle ergeben sich manchmal Situationen, die ein operatives Eingreifen notwendig machen. Unbehandelte Karies und die damit verbundene Zerstörung von Zahnhartsubstanz, sowie weit fortgeschrittene Parodontitis sind die häufigsten Ursachen für chirurgische Zahnentfernungen von z.B. stark zerstörten, nicht erhaltungsfähigen Zähnen und parodontal gelockerten Zähnen. Aber auch Weisheitszähne oder Entzündungen und Eiterherde an Wurzelspitzen können chirurgisch behandelt werden.
Chirurgische Eingriffe erfolgen in der Regel unter lokaler Betäubung. Entzündungen an der Wurzelspitze machen sogenannte Wurzelspitzenresektionen notwendig.